近年来,高性能计算的崛起不仅仅在企业广泛应用,在学术教育领域的需求也日渐增多。云海麒麟在业内领先的技术也得到了知名学府四川大学的青睐。在云海麒麟的帮助下,四川大学成功搭建了一套高性能计算系统。
云海麒麟高性能计算机集群系统
项目需求
提起鼎鼎大名的四川大学(Sichuan University),可谓荣誉无数。四川大学简称“川大”,是中国“985工程”和“211工程”重点建设的大学之一,同时也是首批入选“2011计划”、“珠峰计划”、“111计划”、“卓越计划”的高校之一。
四川大学还是是国家32所副部级大学之一,教育部批准建研究生院的56所高校之一,研究生自主划线的34所名牌大学之一,“国家海外高层次人才创新创业基地”,被誉为西部第一学府。
而正是因为四川大学的地位和学术需求,为了进一步加深对特殊材料的“分子设计”和制备方法的探索,四川大学化工学院希望采购一套高性能计算系统。而作为顶级学府,该系统将结合使用Gaussian等相关软件进行量子化学的科学计算和数据分析等,同时进行并行计算和深度计算,属于计算密集型高性能计算系统。
由此可见,这一HPC系统对LINKPACK性能值和LINKPACK效率等要求都是要达到最好。HPC系统对研究方向所涉及的大规模高复杂性系统模型验证算法、大规模数据处理与服务等问题的研究要提供有效的支撑平台,对在整个实验室运转过程中的各种高性能与大容量应用要求和服务提供支撑平台。
此次所建设的HPC集群系统所需服务器主要用于高性能科学计算,对化学领域的高分子运动规律和结构进行精确计算、精确分析等,因而对处理器的浮点运算和网络效率都要求高。
解决方案
云海麒麟高性能计算集群系统采用了业内领先的技术,并通过了Intel集群验证实验室的Intel cluster Ready (ICR)认证。通过专业的集群管理软件,实现了集群部署的自动化,快速化,同时使整个集群系统更易于管理员管理,形成了一套单一映像的集群软件架构。
云海麒麟高性能计算集群系统的软件和硬件以及基础架构都力求规范、标准、开放、高效,以方便用户使用和在其平台上开发自己的应用。因此,该平台可最大限度的提高应用的效率和移植性,适合于石油勘探、数值气象预报、流体力学分析、CFD、基因科学、多媒体、金融数据挖掘分析等多种领域多种应用的部署。
在这一方案中共配置40个计算节点,由10台YH-5204C高密度四子星服务器组成;1个作业调度及监控管理节点YH-5210,TB级存储YH-5424S与千兆交换机互联系统,大规模机房管理KVM切换系统、监控系统以及内置控制台等共同构成了高速计算、海量数据传输网格计算集群系统,以及云海麒麟特别设计的HPC管理系统方案等等,共同构成四川大学高性能计算集群。
这套系统40个计算节点的峰值运算能力为13万亿次每秒。系统采用云海麒麟Cloudkirin Cluster Manager作为管理软件,主要应用软件是Gaussian及专门针对集群平台的编译器、优化工具、调试工具,以及高效的数学库等。