生物科研需要更大的内存 专访李亦学教授

    作为完成中国第一套采用英特尔四核服务器并完成部署的关键人物，李亦学教授在3月20日，也就是英特尔多核日这一天倍受推崇，无数媒体都把镜头对准这了位在学数上造诣深厚，在科技应用上更是敢为天下先的“勇者”。那么究竟是怎样的应用，怎样的思想让这样一位治学严谨的教授接受四核，时至今日，他的四核之旅究竟如何呢？在这一天，我们采访了李亦学教授。

李亦学教授简介：

    李亦学教授现任上海生物信息技术研究中心主任；中科院上海生科院生物信息中心主任；我国十一·五计划生物医药领域专家组组长；上海交大生命科学技术学院生物信息系教授、博导。是我国将高性能运算技术引入到生物科研领域的权威学者，有着多年国内外研究经验，同时还是我们生物信息技术研究的专家。曾经对IBM、SGI、SUN等品牌的高性能计算产品进行过深入的研究，在如何选择高性能计算产品方面，有着独到的见解。

生物科学计算需要大内存

    对于为何在丰富的选择中选择刚刚问世的四核服务器产品，李亦学教授讲到：我们的确需要很大规模的运算，但现在的生物学发展对计算机有了复杂的要求，现在很多应用需要大量的内存，我一般要求各节点的内存必须达到128G以上。

    很多人还在用多节点去解决问题，然而对于我们来说，我们更需要多线程的计算，让更多的运算跑起来，这无疑需要更大的内存。而四核的产品就能解决我们的这一需要。应当说我们是一个以高可用性的用户。

在对服务器进行选择的时候最关键的是应用其次是性价比

    “我们的经费其实很紧张，但第一位的是如何满足我们的需求。”作为生物信息领域当中的专家，李亦学教授非常清楚进行每项科研时需要进行的计算，所以他对于各大厂商提出的方案都有着清晰的思路。

    在谈到具体应用的时候，李亦学教授专门谈到了对联想的方案实验室的赞赏，因为联想的实验室会根据他的需要进行模拟，特别是将胖节点与瘦节点结合的模式，让李教授对实际的部署效果可以更加明确。