六十年来，在我国理论化学奠基人唐敖庆院士的领导下，吉林大学逐渐形成了我国的理论化学中心。1978年经国家科委批准，在吉林大学建立了理论化学研究所，唐敖庆院士任所长。目前我国从事理论化学研究的大多数高级科研工作者都直接或间接在吉林大学理论化学研究所学习和进修过。1989年在唐敖庆院士建议下国家计委批准在吉林大学建立理论化学计算国家重点实验室，也是我国唯一从事理论化学基础研究的国家重点实验室。首任实验室主任为孙家钟院士，唐敖庆院士为实验室学术委员会主任，实验室于1995年11月通过国家验收，1996年2月经原国家教委批准正式对外开放，1999年7月通过首次国家评估。通过首次国家评估后，实验室进行了换届，学术委员会由国内着名理论化学家17人组成，其中中科院院士8人。实验室现有固定人员22人（院士2人，具有博士学位13 人），固定人员的科研成果曾获2000年国家自然科学奖二等奖，2001年中国高校自然科学奖一等奖，2003年吉林省科学技术进步一等奖。
吉林大学理化所的高性能集群主要面向整个理化所提供高性能服务，为吉大理化所公共计算平台，需要支撑的应用种类繁多，基本涵盖了理论和计算化学领域主流及专业应用。
曙光公司的技术方案采用了基于上海超级计算中心曙光4000A/5000A（这两套系统分别在2004年和2008年获得全球超级计算机排名前十）的设计、实施及运营的成功经验，其设计原则是：高性价比、高稳定性、面向多种应用计算类型。而从实际应用角度来讲，无论是计算能力、管理能力还是以后的扩展能力都达到了非常高了水平，得到了客户的高度评价。系统配置128个双路计算节点，还配置2台八路和2台四路SMP胖节点，适用于某些有特殊需求或要求苛刻的算例；采用高性价比的FC-SAN存储，通过6台IO节点提供48T共享存储空间，IO节点使用万兆接口提高并发IO性能；
整个高性能计算平台各个子系统配比均衡，既能将大部分计算资源满足主流应用的需求，又能对特殊应用进行响应，完美地支撑了吉林大学理化所的教学和科研工作。
