北京应用物理与计算数学研究所创建于1958年，是一个以承担国家重大科研任务为主，同时开展基础和应用理论研究的多学科研究机构。建所至今，取得了大批研究成果，涌现出一大批有突出贡献的专家学者。研究所的主要研究领域有：理论物理、粒子物理与原子核物理、等离子体物理、激光物理、流体力学、应用数学、计算数学、计算机应用、军备控制科学技术。
北京应用物理与计算数学研究所相关研究工作都离不开高性能计算机作为基础工具，对高性能计算资源有巨大需求，应用软件中有常用的计算物理、计算材料类软件，也有用户自开发的大规模并行软件，这些应用对高性能计算平台的计算能力、网络性能、存储性能都有极高的要求。
2009年，曙光为北京应用物理与计算数学研究所建设的高性能计算平台作为所内及所外合作研究的公共计算平台、服务于全所科研任务。全系统共计420台刀片节点、计算峰值达到40.32万亿次/秒，在2009年中国高性能计算机性能TOP 100中排名第8；存储系统采用分布式并行存储架构，配置78 TB全局共享存储，提供了充足的I/O带宽；计算网络采用线速互联的InfiniBand网络，用于保障并行计算软件的并行效率。另外，用户熟悉使用多年的原有作业调度系统，为此曙光专门针对作业调度系统进行了封装和定制开发，既给用户提供了熟悉的使用环境，又提高了整个系统的资源调度效率。
北京应用物理与计算数学研究所高性能计算平台使用至今，运行状态良好，资源利用率常年达到70% 以上，已经支撑了众多科研项目，发挥了极为重要的作用。系统运行开始，曙光提供了深入的系统软硬件调试和优化，曙光完善的售后服务体系也保障了系统的良性运维。
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